過去的流程 — 兩年前從EVERNOTE跳到DEVONthink後，不斷嘗試不同的組合，還實現GTD流程。不僅是DEVONthink，也需要把Omnifocus整合到整個我的工作流程。最終去年我的流程如下： 流程問題 但是這樣的流程對我而言有幾個問題： 檔案放在DEVONthink會與在Omnifocus的任務脫節。 DEVONthink專案筆記也會與任務脫節。 Omnifocus的任務也與我每天的日記脫節。 因為上述三個因素，我一直在尋找可以整合筆記、任務與檔案管理的工具，終於我在SetApp中找到這個NotePlan3。 透過NotePlan3，我們可以把任務與筆記串連在一起，而檔案可以依附在 筆記或者任務。更進一步NotePlan可以結合日曆系統，讓我們的工作與筆記串連在一起，讓筆記成為工作流程的一部份，而不是獨立的存在。 因此導入NotePlan後我的新流程： 捕捉Capture：Draft, DEVONthink, Dropbox, NotePlan

Markdown 引用文獻 Citation 與Reference方法 在文章段落中加入各種相互參照，是zettelkasten重要的作法，不僅讓自己可以在自己的筆記相互參照，在寫作學術文章也是重要的技能。此外，不僅僅是學術文章，我們在寫一般的部落格文章，若能夠增加站內文章的相關參考自我引用，對於提供網站SEO也是即有幫助的作法。 我們在markdown筆記中要呈現相互參照，有幾種住要的作法。最主要的作法有下列兩種：Inline citation, Bibliography Citation。下面我們就來介紹ㄧ下這兩種方法，在markdown上如何呈現： Inline Citation 我們最常使用的inline citation，主要是直接把段落中的文字變成超連結，並加上超連結的功能。可以讓我們直接點選文字就可以連結到該連結。Markdown針對這種方式提供了三個作法。 Wiki link：

撰寫文章必須要建立在巨人的肩膀，因此在Markdown 中引用文獻或其他文章，或者建立自我文章的相互連結非常重要。下面介紹ㄧ下，在Devonthink 使用markdown格式的一些引用方法： 直接引用 wikilink 在ZKnote有個方法，可以套過wiki link 把所引用的筆記直接嵌入文章段落中。 直接使用[[標題]]的方式引用。 Devonthink Item Link 目前我筆記系統選擇使用Item link …

你是否在在搜尋研究主題或者文獻收集時，在各種研究平台跳轉來去？是否不斷的在搜尋條件中來回徘徊？這個由Devontechnology 開發的強大搜尋工具DevonAgents可以幫點忙。過去我主要搜尋醫療的文獻，因此主要在Google scholar與Pubmed中遊走。最近因為接觸資訊領域的文章，常常需要跨領域的搜尋。Google scholar與PubMed找到的文章內容就顯的侷限。因此開始廣泛使用DevonAgents來進行我的研究的第一步：Literacture Review。 下面簡單介紹ㄧ下，我目前怎麼使用DevonAgents，以及如何與Devonthink搭配呢？ DevonAgent 主要特色： 可以準確搜尋，類似google的一些搜尋語法。 可以搜尋Devonthink資料庫 可以在同一介面搜尋不同資料庫(如Pubmed, Google. Googleschoar等） 可以快速貯存搜尋條件(包含所搜尋的keywords以及目標資料庫)

Bookend 其實也有提供URL scheme，但是我更常使用Devonthink的連結來處理檔案。因此有效的串連兩個資料庫，可以夠有效的利用文件。 過去如果我要在兩邊找一個文章，我需要用search的方式來尋找，不管是在Bookend或者Devonthink中搜尋，總是需要好幾個步驟。 自從有了Hook可以快速建立連結後，我開始思考如何利用Hook來連結兩個資料庫。不過在網路上找不到現成的Apple script來處理，因此我想到了利用Keyboard maestro 加上Alfred+ 來處理。 前置步驟： 你必須要有bookend 與Devonthink，也必須有Alfred +powerpack以及 keyboard Maestro。 Alfred 中安裝 Devonthink 延伸workflow（David Mohl版）（雖然Charles Ma版本功能較齊，但是在後續處理會有問題）

本文參考： 1. Using Hook with DEVONthink by DEVONtechnologies — Hook 2. Hook Productivity 修正Hook and Devonthink Create Note 這個檔案hook 到Hook 官方網頁有關Devonthink 與hook 連接的網頁： 使用Hook create new note 來創造新的connected note來註解原始檔案。 原本預設的檔案格式是rtf，我已經改成 Markdown比較符合我的設定 設定的畫面在Preference中的script，找到Devonthink頁面，選最右邊的new item。下面就可以編輯apple script。整個作法是呼叫apple script來達成的。 把語法改成下列格式，就可以實現直接Create Markdown 筆記了。 實際使用 個方法可以取代在Devonthink中建立Annotation，連結建立在Hook中，不用擔心同步後Devonthink Annotation連結喪失。更可以跨Mac保留連結。

Prefix Finally, I integrate these three lethal weapons for academic writing: Bookend, Scrivener, and Mellel 5. I have done my master thesis and several journal articles these years with MS word. However, using Word to complete a thesis is really painful. The integration of Mendeley to MS word is quietly performed…

The Scrivener Bookmark The Inspector of Scrivener has a column of the bookmark. Here, we can attach the internal bookmark of the document and the link to external files or websites. This bookmark is single item-specific. That means it will attach a specific item in Scrivener, including group or text. Therefore, I can…

自從從Evernote搬家到Devonthink後，我已經徹底改用Markdown個是來做日記。雖然Markdown格式簡單乾淨，使用一些語法也可以達到不錯的效果。但是過去使用Evernote，把日記寫的圖文並茂的體驗卻消失了。 這幾天因為開始學習一些專案的拆解，找到了OmniOutliner這個軟體。雖然過去有一段時間曾經試用，但是當時出發點是要找Draft App的替代方案，相較之下Outliner與draft 確實不是同一種產品。因此這樣的比較，不意外的沒有正面的評價。參考這篇文章。 這一次以尋找Project 拆解以及寫作的概念出發，還真的將outliner玩出一個新花樣，也真正的能夠在我的workflow中扮演一定的角色！ 後續我再接再勵，嘗試把日記也更換成Outliner格式，效果意外的好！ 然而還是有一些優缺點需要來比較ㄧ下，下面針對兩個格式優缺點來做ㄧ下比較！（強調ㄧ下，這邊所比較的markdown是使用devonthink的使用體驗，有些人使用obsidian或類似typora可能有所不同。）